Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms