Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC2HC1C-203ENST00000524913 4283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA2-214ENST00000611957 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC18A1-205ENST00000440926 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EFCAB13-203ENST00000517484 3466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FAN1-203ENST00000561607 2690 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LUARIS-201ENST00000436105 2916 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL32-204ENST00000536676 3699 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CAB39L-212ENST00000610540 3692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2D3-209ENST00000394804 4166 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIK1-203ENST00000389125 3140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IQGAP1-214ENST00000560738 3602 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EZH1-217ENST00000590078 2392 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PLP1-220ENST00000612423 3132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SIN3A-208ENST00000567289 4078 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IQCA1-206ENST00000431676 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TMOD1-203ENST00000395211 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108099.1-201ENST00000564402 3258 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TDRD3-201ENST00000196169 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFAIP3-201ENST00000237289 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRT-211ENST00000618610 3230 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms