Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
LTBP4Q8N2S1 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 LCA5-201ENST00000369846 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 PPFIBP1-207ENST00000537927 5719 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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