Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RN7SL14P-201ENST00000579715 298 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 STRADA-246ENST00000640397 1045 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CD40LG-201ENST00000370628 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 EPB41-202ENST00000347529 2676 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ONECUT2-202ENST00000491143 16121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC026124.1-201ENST00000545709 3457 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 MRRF-202ENST00000344641 9826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PABPC3-201ENST00000281589 3387 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 BCO2-201ENST00000357685 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 METTL7A-203ENST00000548553 4076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL590004.4-201ENST00000566733 7060 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 OR51D1-202ENST00000641817 3561 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ARMCX5-GPRASP2-206ENST00000476910 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 STX18-AS1-206ENST00000608184 3047 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 DAZ2-207ENST00000382449 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 FRG2-201ENST00000378763 2084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 FRG2B-202ENST00000443774 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RBM18-201ENST00000417201 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CCL13-201ENST00000225844 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC009228.1-203ENST00000430105 432 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC112203.1-201ENST00000506315 1020 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC008581.1-201ENST00000512650 385 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 LINC01397-201ENST00000554808 579 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC005884.1-201ENST00000588604 429 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 GC-201ENST00000273951 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SLC17A2-202ENST00000360488 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 IL2RA-202ENST00000379954 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 HELQ-201ENST00000295488 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 STAT2-202ENST00000418572 1548 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 CDH13-202ENST00000428848 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 ZFP30-204ENST00000514101 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 VPS11-206ENST00000614944 3388 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 CLDN8-201ENST00000399899 2068 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 WDPCP-206ENST00000409562 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 LAX1-202ENST00000367217 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 ZNF33A-208ENST00000628825 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 HGF-209ENST00000457544 2249 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 PSMC1P7-201ENST00000495689 1315 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 ZNF215-202ENST00000414517 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms