Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 USP6-205ENST00000574788 8464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 MEGF10-201ENST00000274473 7594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 JADE1-203ENST00000452328 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 DISP1-201ENST00000284476 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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PKHD1P08F94 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 FBN2-208ENST00000619499 10154 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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PKHD1P08F94 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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PKHD1P08F94 EPHB2-204ENST00000400191 10816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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PKHD1P08F94 SEC16A-203ENST00000313050 8806 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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PKHD1P08F94 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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PKHD1P08F94 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
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PKHD1P08F94 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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