Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms