Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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