Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERG28Q9UKR5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms