Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42EP3Q9UKI2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms