Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VTI1BQ9UEU0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VTI1BQ9UEU0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms