Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIP2Q9UDT6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms