Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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