Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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