Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms