Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms