Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms