Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTL1Q9NRR1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms