Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms