Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms