Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms