Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGB3Q9NQW8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
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