Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms