Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms