Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFRA4Q9GZZ7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFRA4Q9GZZ7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms