Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms