Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms