Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms