Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM14BQ9BX40 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LSM14BQ9BX40 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LSM14BQ9BX40 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LSM14BQ9BX40 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LSM14BQ9BX40 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LSM14BQ9BX40 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LSM14BQ9BX40 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms