Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms