Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG101Q9BSB4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms