Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQJ4

TMEM47, Transmembrane protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM47Q9BQJ4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM47Q9BQJ4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM47Q9BQJ4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms