Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms