Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms