Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHP1Q99653 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms