Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP1Q99575 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP1Q99575 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP1Q99575 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP1Q99575 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms