Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NAP1L3Q99457 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NAP1L3Q99457 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms