Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ODF3Q96PU9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms