Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms