Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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C2orf48Q96LS8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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C2orf48Q96LS8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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C2orf48Q96LS8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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C2orf48Q96LS8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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C2orf48Q96LS8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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C2orf48Q96LS8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C2orf48Q96LS8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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C2orf48Q96LS8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C2orf48Q96LS8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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