Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KCNS1Q96KK3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms