Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms