Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms