Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms