Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BORCS6Q96GS4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms