Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CFAP36Q96G28 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms