Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms