Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms