Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PLD3Q8IV08 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms