Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms