Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms